第二天光绪帝率领恭亲王奕?、翁同龢等重臣由松云保驾离开金陵。临走之前，光绪帝命令肃亲王善琦及鄂泰带领人马留守金陵保护太后。
慈禧派人请来肃亲王，语重心长地对他说：“自咸丰皇帝驾崩以来，哀家与东太后（慈安太后）一起垂帘听政，至今已有三十余载，我也想让大清恢复往日的繁荣，故支持曾国藩、李鸿章等人进行洋务运动，以增强国力，永远立于不败之地，没想到啊!”叹了一口气。
肃亲王说：“你支持的洋务运动起到了很好的效果，没有什么要自责的啊！”
慈禧太后说：“你知道的，洋务运动时建立的海军，本应该在保卫国家时发挥作用，但是，在甲午战争中，北洋水师却一败涂地，你说这能是大清的寿数到了吗？”
肃亲王说：“虽然甲午海战我们失败了，但是第二次日本入侵，被我们打的落花流水屁滚尿流，日本人以失败告终，也算扳回来一局啊！”
慈禧太后说：“第二次日本人入侵辽东，我们取得了胜利，但是，如果没有唐峰率兵增援旅顺，我军很难取胜，不是吗？”
肃亲王说：“说是这样说，你说这个唐峰也是，皇帝让他坐镇东北，位列八大总督之一，官居一品，位极人臣，也算对他恩重如山了。没想到他居然造反了，竟然另立政府与大清分庭抗礼，简直不可理喻！”
慈禧太后说：“唐峰造反这个事怪我！”
肃亲王说：“这个事怪就怪唐峰忘恩负义，怎么会怪你呢？”
慈禧太后说“当年我不应该听康有为的建议，把唐峰给激怒了，应该逐渐削弱了唐峰的权利，他就没有理由造反了，也就不会有今天的局面了！”
肃亲王说：“事情都已经过去了，你也别自责了，现在再说这些也没有用了，唐峰部队现在正如日中天，他能收手吗？如果能放过我们清朝王室，让我们王室得到好的归宿就谢天谢地了，现在只能听之任之了！”
慈禧太后说：“祖上创下的大清帝国，到了我这里，难道就这样毁了吗？嗨！”
肃亲王说：“太后！别想那么多了，先说我们现在怎么办吧？”
由张智展率领的雷霆纵队第一集团军和由刘步蟾率领的第一舰队先后来到金陵城外安营扎寨，与已经赶到这里的第二集团军会师后。他们收到了雷霆纵队司令部发来的电报：根据战场形势的需要，现决定成立金陵前敌委员会，由刘伟晨任主任，张智展、杨国誉、顾竞文、刘步蟾任委员，由前敌委员会统一指挥金陵前线各部队作战。务必尽快攻占金陵。
把总司令部的电报宣读之后刘伟晨说：“各位！按照总司令的命令，接下来的作战行动，将由我统一指挥，希望大家能够精诚团结，齐心协力尽快拿下金陵，抓住光绪帝和慈禧，早日结束战争！”
刘伟晨接着说：“大军远道而来虽然舟车劳苦，但是事不宜迟，必须做好立即进入战斗状态的准备！”
雷霆纵队第一军在江云峰指挥下开始向汤山、栖霞山、牛首山一线的清军阵地发动了猛烈进攻。在陆军行动的同时，负责封锁江面的定远、镇远、福远等舰也向清军阵地开炮射击。
清军遭到攻击后，凭借坚固的防御工事负隅顽抗，虽然雷霆纵队的进攻被阻挡了，鄂泰分析战场形势后很不乐观，他认为雷霆纵队会加大攻势，防御阵地不会坚持多久，又不甘心放弃阵地，坚持下去会造成大量人员伤亡，放弃阵地会被别人认为临阵脱逃，是坚持，还是放弃，难以抉择啊？他皱着眉头在办公室里踱了两圈步之后，想到了不是办法的办法，就是再找一个人分担责任，大声说：“来人！去把肃亲王善琦请来！”
鄂泰经与肃亲王商议决定，由肃亲王在城内坐镇，鄂泰亲自赶到战况最紧急的栖霞山督促指挥战斗。
鄂泰到栖霞山前线阵地后，驻守的军官都围上来七嘴八舌的问怎么办？
鄂泰说：“弟兄们！你们是大清的军人，面对叛军应该镇定自若，怎么能如此慌乱啊？我们背后就是金陵城，皇上和太后就在城里（光绪帝离开金陵之前下令封锁消息，所以士兵们不知道他已经离开。）清廷对你们皇恩浩荡，你们应该精忠报国，为保卫皇上的安全，就要守住金陵城，要拼死守住阵地，要誓与阵地共存亡。大家有决心吗？”
有一个带头高喊：“誓与阵地共存亡！”其他人跟着附和，但是没有底气。
鄂泰听了很不满意，又大声问“有决心吗？”这次回答的声音很响亮。鄂泰说：“大家各自去准备迎战吧！”
刘伟晨在作战室商量破敌的对策，他说：“金陵城是六朝古都，周围地势险要，城防体系完备，夺取金陵城一定会有阻力，金陵城只能智取，不能强攻，大家出出主意，我们应该采取什么样的战略战术为好？”
顾竞文提议：“总参谋长！我建议让特战总队参加战斗，对敌人实施特种阻击战，重点射杀他们的指挥官、机枪手和炮兵观察员，以削弱他们的战斗力！”
姚顺雨说：“参谋长！我们可以在夜间突然发动进攻，他们夜间戒备肯定松懈，我们出其不意攻其不备，夜袭成功的可能性大些！”
刘伟晨听后沉思片刻说：“就按顾总队长和姚军长说的办，大家现在回去准备，今夜发动进攻！”